Verfahren und Vorrichtung zur Bestimmung der Mehr Alssten Phänotypischen Charakteristika aus einem Genomischen Sequenzstrom

Details

Veröffentlichungs-Nr.

EP4760724

Anmeldetag

31. Januar 2025

Veröffentlichung

17. Juni 2026

Rechtsraum

EP

IPC

G16B20/00, G16B30/10

Abstract

Un procédé de prédiction phénotypique d'un organisme en fonction de son génome, comprend un séquençage du génome de manière à produire des reads, délivrés en temps réel et/ou par lots à intervalles réguliers ou périodiques, et un traitement itératif comprenant une mise à jour d'un ensemble de reads en fonction des nouveaux reads délivrés, une détection des k-mers présents dans l'ensemble, une prédiction phénotypique en fonction des k-mers détectés; et la délivrance de la prédiction lorsqu'un critère d'arrêt est atteint.Le critère d'arrêt est atteint si la variation du nombre de k-mers détectés est stable pendant un premier nombre prédéterminé d'itérations et si la variation du caractère phénotypique est stable pendant un second nombre d'itérations et si la variation de la profondeur de séquençage entre deux itérations est supérieure à un seuil prédéterminé.

Anmelder

Firma

bioMérieux

Land

🇫🇷 Frankreich

Fachgebiete